Ordet mikroorganisme kommer fra græsk, dannet af "mikro", hvilket betyder lille, plus roden "organon", der betyder organ, værktøj eller instrument, og suffikset "ism", der betyder aktivitet eller system. Mikroorganisme forstås som alle disse organismer, livsformer eller encellede levende væsener , i deres flertal, skønt de i nogle tilfælde er cenotiske organismer, der består af meget små flercellede celler eller endda flercellede, som kun kan opdeles ved hjælp af et mikroskop; Den videnskab, der studerer disse mikroskopiske fænomener, er mikrobiologi. Disse mikroorganismer inkluderer bakterier, vira, skimmelsvampe og gær.
Disse mikroorganismer, også kaldet mikrober, er det værd at bemærke; De kan forårsage skade eller forringelse af mange fødevarer og dermed forårsage sygdomme, når de indtages på grund af deres forurening. Disse er patogene mikroorganismer, som, hvis de ikke bekæmpes i tide, kan den inficerede person, dyr eller plante lide sygdomme, der kan generere komplikationer og dermed sætte dit liv i fare eller også inficere mennesker, der har kontakt med dem. Selvom der kan være nogle patogene mikroorganismer, der ikke forårsager en sådan forringelse i mad, og det er derfor vigtigt at tilføje, at der er nogle mikroorganismer, der normalt er til gavn og fordel, indtil de anvendes til forarbejdning af fødevarer for at forlænge deres holdbarhed eller ændre deres egenskaber; et almindeligt tilfælde af dette er gæringen, der udføres til produktion af oste eller yoghurt. Og endelig kan vi sige, at mikrober har forskellige størrelser og former.