Udtrykket religiøs intolerance henviser til en form for intolerance over for religiøs overbevisning eller praksis eller, hvis ikke, manglen på sådanne skikke, som en person eller gruppe besidder. Dette kan være forårsaget af flere faktorer, blandt dem kan nævnes det faktum at have forskellige religiøse overbevisninger, have en anden ideologi såvel som ved den enkle kendsgerning at have et antireligiøst synspunkt. Denne type holdning kan endda føre til aggressionfysisk, verbal, psykologisk, blandt andre. Et klart eksempel på denne form for intolerance i religiøs forfølgelse, der opleves i forskellige dele af verden i dag. Hovedårsagen til, at denne type holdninger fra samfundets side finder sted, skyldes hovedsageligt fraværet af religiøs tolerance, religionsfrihed og pluralisme med hensyn til religion.
Det er vigtigt at bemærke, at der ikke er nogen enkelt årsag, der forklarer religiøs intolerance, men det er muligt at tale om et meget generaliseret argument blandt dem, der udøver en religion og er intolerante over for andre. Dette argument er meget simpelt: generelt anser alle deres religion for at være den sande, derfor er det normalt for dem at modsige dem, der forsvarer falske doktriner fra deres synspunkt.
Dette er et fænomen så gammelt som religionens rette oprindelse. I gamle tider, da de første kristne gennemførte deres ritualer, måtte de gemme sig i katakomberne, da den romerske regering dengang ikke tolererede sådan tro. Siden oldtiden har det jødiske folk været offer for forfølgelse mange gange i deres historie, og den vigtigste motivation for denne forfølgelse var netop fjendtlighed over for de skikke og overbevisninger, de har.
På den anden side blev de præcolumbianske folks religiøse vision kæmpet af de kristne, da de ankom til det amerikanske kontinent. Selv inden for selve kristendommen har der været tilfælde af intolerance over for andre kristne doktriner, som er klassificeret som kætterier eller afvigelser fra den autentiske tro. Alle disse nævnte tilfælde er et tegn på, at afvisning og intolerance over for andres tro har været en konstant, der er sket siden umindelige tider og fortsætter den dag i dag.