Hydrogensomer er de mærkeligste eukaryote organeller med den højeste vækst i verden. Denne organelle er placeret i cytoplasmaet, den er sammensat af et dobbelt væv, hvor den indre membran giver et kam udseende. Hydrogenensomer udviklede sig fra mitokondrier ved lækage af elementære mitokondrieegenskaber, såsom tab af deres genom.
Størrelsen af disse organeller er ca. en diameter. Dets vigtigste funktion er at gribe ind i den fermenterende stofskifteproces af nogle væsener, der er valgt til at erhverve ATP (energimolekyle) under omstændigheder med iltmangel. Det skal bemærkes, at denne funktion svarer til mitokondriel respiration udført af anaerobe mikroorganismer. I dem nedbrydes pyruvinsyrer, som er de væsentlige molekyler i stofskiftet, det er placeret nøjagtigt i midten af stierne for at få energi fra hvert eneste levende væsen. Nedbrydningen af pyruvinsyrer er en proces, der udføres af hydrogenomet, der absorberer CO2, acetat, der udvises i cellecytoplasmaet.
Nu kan processen forklaret ovenfor beskrive udviklingen af mitokondrier, men dette skal man finde ud af meget nøje, da det ikke vides nøjagtigt, om mitokondrier og hydrogensomer er organeller, der har udviklet sig sammen. Specifikt ville det være nødvendigt at undersøge, om hydrogensomer har elektrontransportkæder. Dette er entydigt vigtigt, da brintransport er kompromitteret inden for respirationsprocessen. Hvis begge organeller nu bruger lignende proteiner, kan det udledes, at de er forbundet, og ved at kontrastere disse proteiner med lignende bakterier, vil det være muligt at vide, om hydrogensomerne stammer fra mitokondrierne eller tværtimod, de har uafhængig oprindelse
Endelig skal det tilføjes, at opdagelsen af disse organeller blev foretaget i 70'erne.
