Inden for det videnskabelige område er methylenblåt kendt som methylthioninchlorid, det er et farvestof, der bruges som farvestof til at pigmentere nogle dele af en persons krop før eller under operationen. Læger bruger det grundlæggende som en antiseptisk og intern kauterizer.
Det bruges også som maling i pletter til observationer foretaget gennem et mikroskop og til at male resultaterne i laboratorier, da det har evnen til at farve urin og afføring. Endelig bruges det også i behandlingen til at mindske methemoglobin. Blandt dets karakteristika er, at det er et element, der består af krystaller, af en lys mørk grøn farve, det har ingen lugt og ændres ikke af luft.
Det kan let opløses i vand og forsigtigt i alkohol, og når det er i kontakt med dem omdannes farven til en dyb mørkeblå, den bruges også til at bekæmpe neglesvamp, den kan også bruges til at male hvidt tøj, når det er begynder at blive gullig.
I akvakultur bruges det i vid udstrækning til behandling af infektioner i tropiske fisk, det er meget effektivt til at bekæmpe den protozoan parasit, som er den, der forårsager infektioner hos fisk. Dybest set bruges det til at tage sig af de æg, der for nylig er lagt af fisken, så de ikke inficeres af bakterier eller svampe, det er meget nyttigt, hvis du kunstigt vil inkubere æggene. Folk kan købe methylenblåt uden recept, det bruges generelt som et topisk antiseptisk middel.
